Молдавская Библейская Семинария (МБС) была основана в 1995 году отвечая на нужду в качественной подготовке служителей для протестантский церквей в Молдове. Изначально МБС задумывалась как полноценное университетское образование.
Обучение было задумано на английском языке для того, чтобы дать студентам доступ к высококвалифицированным преподавателям и многочисленным ресурсам доступным по всему миру. Первые шесть выпускников получили дипломы в 1999 году. В 1997 году МБС была зарегистрирована как составная часть Библейской Церкви в Республике Молдова.
За годы своего существования МБС выпустила десятки служителей, многие из которых трудятся как в Молдове, так и за ее пределами.